陈心浩,胡 俭.基于多特征融合预测蛋白质相互作用界面[J].中南民族大学学报自然科学版,2017,(3):80-83
基于多特征融合预测蛋白质相互作用界面
Study on Protein-Protein Interfacial Classification Based on Multi -feature Fusion
  
DOI:
中文关键词: 蛋白质-蛋白质界面  分类  进化  特征选择
英文关键词: protein-protein interface  classification  evolutionary  feature selection
基金项目:国家自然科学基金资助项目(61002046) ; 中央高校基本科研业务专项基金项目(CZP17025)
作者单位
陈心浩,胡 俭 中南民族大学 生物医学工程学院武汉 430074 
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中文摘要:
      为高效准确地预测蛋白质相互作用界面,提取了传统特征,并采用多种方法改进进化信息特征, 利用特征 选择构建了一个 14 维的预测模型. 通过 5 折交叉验证和独立测试, 预测结果表明: 该预测模型不仅显著降低特征 维度,而且选择的特征组合具有较好的预测能力和较强的泛化能力.
英文摘要:
      To build a model of efficient and accurate classification of protein-protein interfaces, this study constructs two characteristics of traditional features and evolutionary information, a 14-dimensional feature model is constructed by feature selection. By cross-validation of the main data set and independent test set testing, results show that selects the features combination has better predictive ability and strong extension ability. Compared with the best models at the present stage,this study significantly reduce the dimensionality of the model case classification has improved.
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